Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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