Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SCGB2A2Q13296 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SCGB2A2Q13296 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SCGB2A2Q13296 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SCGB2A2Q13296 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SCGB2A2Q13296 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SCGB2A2Q13296 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SCGB2A2Q13296 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SCGB2A2Q13296 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
SCGB2A2Q13296 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SCGB2A2Q13296 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms