Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NME3Q13232 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NME3Q13232 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms