Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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BPTFQ12830 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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