Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms