Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms