Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms