Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM3Q01628 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms