Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ASIC1P78348 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms