Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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