Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms