Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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