Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB3P54753 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms