Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms