Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms