Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms