Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
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PTPRMP28827 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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PTPRMP28827 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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