Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms