Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
YY1P25490 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
YY1P25490 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
YY1P25490 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
YY1P25490 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
YY1P25490 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
YY1P25490 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
YY1P25490 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
YY1P25490 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
YY1P25490 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
YY1P25490 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
YY1P25490 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
YY1P25490 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
YY1P25490 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
YY1P25490 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
YY1P25490 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
YY1P25490 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
YY1P25490 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
YY1P25490 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
YY1P25490 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
YY1P25490 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
YY1P25490 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
YY1P25490 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
YY1P25490 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
YY1P25490 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
YY1P25490 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
YY1P25490 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
YY1P25490 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
YY1P25490 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
YY1P25490 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
YY1P25490 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
YY1P25490 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
YY1P25490 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
YY1P25490 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
YY1P25490 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
YY1P25490 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
YY1P25490 CRYAB-213ENST00000533475 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
YY1P25490 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
YY1P25490 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
YY1P25490 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
YY1P25490 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
YY1P25490 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
YY1P25490 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
YY1P25490 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
YY1P25490 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
YY1P25490 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
YY1P25490 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
YY1P25490 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
YY1P25490 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
YY1P25490 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 HIGD2B-201ENST00000311755 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 MAL-202ENST00000349807 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 EIF2B5-202ENST00000432569 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 TATDN3-208ENST00000526997 794 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 TATDN3-213ENST00000531963 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YY1P25490 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms