Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
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