Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRDP23468 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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