Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
GLI4P10075 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
GLI4P10075 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GLI4P10075 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GLI4P10075 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GLI4P10075 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GLI4P10075 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GLI4P10075 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GLI4P10075 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
GLI4P10075 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
GLI4P10075 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
GLI4P10075 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GLI4P10075 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GLI4P10075 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GLI4P10075 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GLI4P10075 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GLI4P10075 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GLI4P10075 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GLI4P10075 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GLI4P10075 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GLI4P10075 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GLI4P10075 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GLI4P10075 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
GLI4P10075 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GLI4P10075 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GLI4P10075 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GLI4P10075 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GLI4P10075 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GLI4P10075 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
GLI4P10075 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GLI4P10075 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GLI4P10075 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GLI4P10075 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GLI4P10075 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
GLI4P10075 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GLI4P10075 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GLI4P10075 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GLI4P10075 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GLI4P10075 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GLI4P10075 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GLI4P10075 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GLI4P10075 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
GLI4P10075 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GLI4P10075 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GLI4P10075 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GLI4P10075 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GLI4P10075 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GLI4P10075 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms