Protein–RNA interactions for Protein: P02655

APOC2, Apolipoprotein C-II, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC2P02655 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC2P02655 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC2P02655 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC2P02655 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC2P02655 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC2P02655 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC2P02655 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC2P02655 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC2P02655 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC2P02655 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC2P02655 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC2P02655 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC2P02655 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms