Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms