Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2Q1Q7Z7E8 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms