Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms