Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AGAP9Q5VTM2 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms