Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms