Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NBPF1Q3BBV0 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms