Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
KNOP1Q1ED39 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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