Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ITSN1Q15811 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITSN1Q15811 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITSN1Q15811 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITSN1Q15811 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITSN1Q15811 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITSN1Q15811 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ITSN1Q15811 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITSN1Q15811 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
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