Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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C1orf61Q13536 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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C1orf61Q13536 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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