Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC005224.1-201ENST00000458492 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 LINC01284-201ENST00000442994 730 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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MKRN4PQ13434 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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MKRN4PQ13434 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
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MKRN4PQ13434 AP001266.1-201ENST00000531155 1044 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 CCDC58P5-201ENST00000536923 432 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 SLIRP-211ENST00000557623 865 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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