Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFIAQ12857 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms