Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms