Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNG1Q06432 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNG1Q06432 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNG1Q06432 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CACNG1Q06432 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNG1Q06432 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNG1Q06432 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNG1Q06432 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNG1Q06432 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNG1Q06432 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNG1Q06432 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNG1Q06432 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNG1Q06432 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNG1Q06432 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CACNG1Q06432 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNG1Q06432 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNG1Q06432 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CACNG1Q06432 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNG1Q06432 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CACNG1Q06432 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNG1Q06432 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNG1Q06432 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNG1Q06432 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNG1Q06432 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms