Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSC2Q02487 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC2Q02487 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms