Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 ETFRF1-201ENST00000381356 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AC090527.1-201ENST00000557965 431 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AC106872.6-201ENST00000514228 1346 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 BOLL-205ENST00000433157 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 SDHD-204ENST00000528021 1071 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms