Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID4AP29374 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms