Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNA2P26232 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms