Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS6KB1P23443 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms