Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTPS1P17812 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms