Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms