Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ODC1P11926 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ODC1P11926 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ODC1P11926 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ODC1P11926 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ODC1P11926 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ODC1P11926 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODC1P11926 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODC1P11926 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ODC1P11926 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ODC1P11926 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODC1P11926 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODC1P11926 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODC1P11926 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODC1P11926 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODC1P11926 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODC1P11926 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ODC1P11926 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODC1P11926 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODC1P11926 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODC1P11926 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ODC1P11926 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODC1P11926 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODC1P11926 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODC1P11926 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODC1P11926 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODC1P11926 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODC1P11926 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODC1P11926 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ODC1P11926 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODC1P11926 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODC1P11926 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODC1P11926 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODC1P11926 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODC1P11926 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODC1P11926 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ODC1P11926 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODC1P11926 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODC1P11926 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODC1P11926 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODC1P11926 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODC1P11926 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODC1P11926 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODC1P11926 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODC1P11926 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms