Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms