Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TULP3O75386 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TULP3O75386 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TULP3O75386 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TULP3O75386 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TULP3O75386 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TULP3O75386 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TULP3O75386 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TULP3O75386 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TULP3O75386 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TULP3O75386 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TULP3O75386 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TULP3O75386 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TULP3O75386 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TULP3O75386 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TULP3O75386 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TULP3O75386 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TULP3O75386 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TULP3O75386 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TULP3O75386 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TULP3O75386 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TULP3O75386 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TULP3O75386 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TULP3O75386 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TULP3O75386 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TULP3O75386 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TULP3O75386 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TULP3O75386 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TULP3O75386 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TULP3O75386 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TULP3O75386 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TULP3O75386 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TULP3O75386 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TULP3O75386 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TULP3O75386 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TULP3O75386 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TULP3O75386 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TULP3O75386 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TULP3O75386 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TULP3O75386 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms