Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC27A2O14975 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms