Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.2 ms