Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms