Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms